Chimie organique et biochimie

Le sujet est renommé de « Chimie organique et biologie moléculaire en documentaires » à « Chimie organique et biochimie ». L’ancien titre, c’était vraiment avoir les yeux plus gros que le ventre, c’était abusé .

Chimiquement parlant, la photosynthèse est une réduction, la respiration est une oxydation. L’une est l’opposée de l’autre, comme sont opposées les acides et les bases.

La photosynthèse et la respiration s’applique aux composés contenant du carbone.

Les composés carbonés oxydés sont dit carbones minérales, les composés carbonés réduits sont dit carbones organiques.

La photosynthèse réduit le carbone minérale pour en faire du carbone organique, la respiration oxyde le carbone organique pour en faire du carbone minéral.

C’est ainsi que les plantes produisent de la matière organique à partir du carbone minéral de l’air qu’est le CO₂ (oui, oui, c’est un carbone minéral ) et que la respiration produit de l’énergie en rejetant du CO₂ ou peut‑être aussi d’autres carbones minérales.

Quand j’étais petit, on me répétait parfois que la nuit les plantes rejètent du CO₂ et qu’il est donc mauvais d’en avoir dans une chambre. En fait, il s’agit probablement surtout des plantes monocotylédones, celles dont les feuilles ont des nervures sans ramifications. En tous cas, c’est cohérent avec la précision que le phénomène se produit la nuit.

Peut‑être que les plantes dicotylédones sont aussi capables d’oxyder les carbones minérales, mais dans une moindre mesure que les monocotylédones. De l’autre côté, les plantes quo peuvent réduire au lieu d’oxyder, ont quand même besoin d’un minimum de lumière, ce n’est pas pour rien qu’elles ont des feuilles.

Une application en ligne pour dessiner des molécules : avogadr.io. Utiliser le bouton de menu en haut à gauche, le bouton avec une icône à trois petits traits horizontaux.

Par exemple pour le trichlorobenzène : trichlorobenzene (avogadr.io).

Le nom des composés doit être écrit en Anglais.

Une phrase à éclaircir :

Une vidéo sur les méthodes d’analyses par séparation des composés. En dessous de la vidéo, le lien vers une play‑list des parties de cette vidéo, une play‑list qui se termine d’ailleurs par cette vidéo qui les rassemble toutes.

Les méthodes d’analyse et de séparation des peptides et des protéines — World of biology — 2017


Play‑list : Les chromatographies (youtube.com).

Des bases de données sur la biochimie entre autres, sur ce site : www.ncbi.nlm.nih.gov.

Un livre qu’on m’a recommandé sur la biochimie humaine : Atlas de poche de biochimie humaine (decitre.fr). On m’a dit qu’il est accessible aux novices. C’est aux éditions Décitré.

Je ne sais plus si j’avais expliqué la différence entre la chimie organique et la biochimie. Tant‑pis si ça fait un doublon.

La chimie organique, c’est la chimie du carbone, par exemple les hydrocarbures et les alcools. Cette chimie reste assez abordable, mais si on s’intéresse à la chimie du vivant, on la trouvera vite limitée. La chimie du vivant inclue la chimie organique, bien sûr, mais plus que cela, comme les être vivants utilisent et produisent plus que des simples composés organiques. La chimie du vivant, c’est la biochimie. La biochimie couvre par exemple des choses comme les composés constituant les parois des cellules, les produits qu’elles rejettent ou dont elles ont besoin, mais aussi des choses plus complexes comme les protéines, ARN, ADN, etc.

La chimie organique, c’est pour commencer, la biochimie, c’est ce qu’en général on espère vraiment pouvoir aborder mais qui est plus intimidant.

C’est aussi pour cette raison que le titre les place dans cet ordre, la chimie organique avant la biochimie.

Les bactéries Gram‑négative, se trouvent chez les humains, dans l’intestin.

C’est une note, j’en dirai plus un autre jour.

Les 20 acides aminés de la vie sur terre, par leur nom complet, abréviation et symbole d’une lettre.

• Acide glutamique — Glu — E
• Acide aspartique — Asp — D
• Alanine — Ala — A
• Arginine — Arg — R
• Asparagine — Asn — N
• Cystéine — Cys — C
• Glutamine — Gln — Q
• Glycine — Gly — G
• Histidine — His — H
• Isoleucine — Ili — I (i majuscule)
• Leucine — Leu — L
• Lysine — Lys — K
• Méthionine — Met — M
• Phénylalanine — Phe — F
• Proline — Pro — P
• Serine — Ser — S
• Thréonine — Thr — T
• Tryptophane — Thr — W
• Tyrosine — Tyr — Y
• Valine — Val — V